Fakhruddin Muchtar menempuh pendidikan filsafat di Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah dan lulus pada tahun 2006. Ia kemudian melanjutkan studi magister di bidang yang sama di ICAS-Paramadina hingga meraih gelar Magister Filsafat pada tahun 2011. Setelah menyelesaikan pendidikannya, Fakhruddin dipercaya memimpin Socmed Society sebagai Direktur (2011–2019), di mana ia mengoordinasikan riset tentang analisis konten media sosial dengan pendekatan sosio-filosofis. Selain aktif di bidang riset, ia juga mengajar filsafat Islam. Karya terbarunya, Logika Jenaka Sang Khoja: Mengurai dan Menertawai Masalah, diterbitkan oleh Sadra Press.