Khoirotun Nisak sebagai salah satu pegiat Mazhab Ciputat. Saat ini ia aktif menjadi direktur program di Paramadina Center For Religion and Philosophy (PCRP), sebagai pegiat forum antariman di "Esoterika Forum Spiritualitas". Ia juga aktif terlibat dalam diskusi filsafat, agama dan isu Antar Iman dalam 5 tahun ini. Belakang, ia meminati isu ekologi dan secara mandiri mengembangkan platform gerakan Ekologi sosial Institut Indonesia (ESII). Ia meraih gelar Sarjana di UIN Syarif Hidayatullah Jakarta dengan gelar (S.Ag) dan meraih gelar magister Sekolah Tinggi Filsafat Driyarkara dengan gelar (M.Fil).